diff --git a/R/templates/update_r_packages.sh.j2 b/R/templates/update_r_packages.sh.j2
index c01efbb4..1bc3d2de 100644
--- a/R/templates/update_r_packages.sh.j2
+++ b/R/templates/update_r_packages.sh.j2
@@ -153,7 +153,7 @@ function r_cran_pkgs() {
             is_mirror=$( echo $l | grep ':' )
             is_mirror_ret=$?
             if [ $is_mirror_ret -eq 0 ] ; then
-                mirror=$( echo $l | cut -d : -f 2 )
+                mirror=$( echo $l | cut -d : -f 2- )
             else
                 mirror=$R_CRAN_MIRROR
             fi
@@ -173,7 +173,6 @@ function r_github_pkgs() {
         logger "update_r_packages: Installing R packages from Github"
         for l in $( cat $R_PKGS_GITHUB ) ; do
             pkg=$( echo $l | cut -d "/" -f 2 )
-            user=$( echo $l | cut -d "/" -f 1 )
             if [ "$ACTION" == "upgrade" ] ; then
                 Rscript --slave --no-save --no-restore-history -e "require(devtools); require(methods); install_github('$l');"
             else